阴离子交换填料与阳离子交换填料互补，其表面修饰有碱性功能基团（如二乙基氨基乙基、季铵基），在适宜pH条件下解离带正电，通过静电作用选择性吸附带负电的蛋白分子。分离过程中，缓冲液pH值需高于目标蛋白等电点，使目标蛋白带负电并与填料结合，再通过增加缓冲液中盐离子浓度（如NaCl）竞争结合位点，实现不同亲和力蛋白的梯度洗脱。这类填料材质多为琼脂糖、聚苯乙烯或硅胶，其中强碱性季铵基填料适用pH范围广（2-12），稳定性强，适合耐高温、耐酸碱的蛋白纯化；弱碱性二乙基氨基乙基填料适用pH范围较窄（3-9），但对蛋白的吸附温和，可减少蛋白变性风险，常用于敏感性蛋白的分离。钙调蛋白填料用于纯化钙调蛋白结合肽（CBP）标签的融合蛋白。CM分离介质推荐
羟基磷灰石是一种磷酸钙晶体，其表面同时存在带正电荷的钙离子位点和带负电荷的磷酸基团位点。因此，它能与蛋白发生独特的混合作用模式：阳离子交换（通过磷酸基团与蛋白碱性基团）、以及金属配位或阴离子交换（通过钙离子与蛋白酸性基团）。这种双重作用使其对不同类型的蛋白（如抗体、酶、核酸）具有独特的选择性。例如，它常用于单克隆抗体的精纯，能有效去除聚集物、Protein A渗漏和病毒。洗脱通常采用磷酸盐梯度或结合使用其他盐类。洪山区层析微球推荐膜色谱填料集成于囊式装置，适合一次性使用和灵活放大。
IMAC是亲和层析中广泛应用的类型之一，尤其适用于重组蛋白的纯化。填料通过螯合配基（如亚氨基二乙酸IDA、次氮基三乙酸NTA）将二价金属离子（Ni²⁺、Co²⁺、Cu²⁺、Zn²⁺）固定在基质上。这些金属离子可与重组蛋白表面暴露的组氨酸标签（通常是6×His）发生配位结合。结合后，通过使用低pH缓冲液、或加入竞争性物质（如咪唑、组氨酸）进行洗脱。IMAC操作简便、载量高、成本适中，已成为分子生物学实验室纯化重组蛋白的方法，但其特异性有时受限于天然蛋白表面的金属结合位点。
连续生物制造（Continuous Bioprocessing）要求填料支持高流速、低背压和数千次循环稳定性。填料如POROS系列和Eshmuno HCX采用灌注色谱（Perfusion Chromatography）技术，6000-8000Å超大贯穿孔允许大分子快速传质，实现10倍于传统填料的流速。这类填料机械强度极高，可承受>3000次循环，配基脱落<1 ppm。优势在于设备利用率高，生产周期从数天缩短至数小时，占地空间减少80%。但开发需配合过程分析技术（PAT）和复杂控制系统。在单抗、胰岛素等稳定蛋白生产中已有商业化案例，FDA已批准连续生产工艺，了未来生物制药从批次向连续生产的范式转变。阴离子交换填料含碱性基团，选择性结合带负电目标蛋白。
蛋白纯化填料，或称层析介质，是生物分离技术的重要一环。它们是由固体基质（如琼脂糖、葡聚糖、纤维素或合成聚合物）与功能化配基化学键合而成的微球颗粒。这些填料被紧密填装在层析柱中，当含有目标蛋白的复杂样品流经时，凭借其表面的特异性或选择性相互作用，吸附目标物或杂质，从而实现分离纯化。填料的性能直接决定了纯化的分辨率、载量、速度和回收率。理想的填料需具备高化学物理稳定性、良好的生物相容性、高载量、低非特异性吸附以及优异的流体动力学性能，以满足从实验室探索到工业化生产的苛刻要求。流穿模式常用于去除杂质，目标蛋白不结合直接流出。洪山区层析微球推荐
填料的配基密度需优化，过高可能引起空间位阻影响结合。CM分离介质推荐
膜分离填料是一种基于膜结构的新型蛋白纯化介质，与传统颗粒状填料不同，其是具有特定孔径和功能基团的多孔膜材料（如纤维素膜、聚醚砜膜、尼龙膜）。膜分离填料的分离原理可分为体积排阻、离子交换、亲和结合等多种类型，其优势在于传质阻力小，可实现高流速操作，大幅提高纯化效率；同时，膜分离设备体积小、操作简便，易于规模化放大，适合工业级蛋白的快速纯化。这类填料尤其适用于大分子蛋白的分离和脱盐处理，可有效减少蛋白在纯化过程中的聚集和变性，提高目标蛋白回收率。但膜分离填料的吸附容量相对较低，分辨率略低于传统颗粒状填料，通常用于蛋白纯化的初步富集或抛光步骤。CM分离介质推荐
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