适量施用
土壤中施入较多的菌肥，虽然不会出现烧根烧苗现象，但也并不是施得越多就越好。盲目大量施用生物菌肥，虽然不会向化学肥料那样造成蔬菜烧根死苗，只是蔬菜植株体内盐类积累增加，有害消费者的圣体健康，恶化土壤质地，但**起码增加了肥料投入成本（因为生物菌肥价格较高），降低蔬菜的栽培效益。因此，应根据不同作物的需要和土壤养分状况，科学地确定生物菌肥施肥量，才能达到增产增收的目的。
在土壤状况比较正常的情况下，一般以亩（667平方米）施用生物菌肥80公斤左右为宜。如果土壤盐渍化程度较高，可适当增加生物菌肥的施用量。一般根据土壤的盐渍化程度高低，每亩（667平方米）可适当增施10～20公斤为宜。 土壤中的微生物，例如抗生性微生物，它们能够分泌***，***病原微生物的繁殖。贵阳工业生物菌肥
基本原则：一般不能与杀虫剂、杀菌剂混用，这样容易杀***肥中的微生物。不能长期暴露于阳光照射下，太阳光中的紫外线会杀***肥中的微生物。在施用前不宜久放，比较好随购随用。菌肥应存放在阴凉干燥处，避免温度湿度过高过低及阳光暴晒。
施用温度：合理施用菌肥的比较好温度为22~35℃，低于5℃或高于40℃施用效果较差。对高温、低温、干旱条件下的农作物田块不宜施用。
施用地块：对于含硫高的土壤和锈水田不宜施用生物菌肥；对于翻浆的水田，一般不用撒施，用喷雾的方法效果会好些。生物有机菌肥采用穴施或沟施的方式进行，不建议冲施。复合微生物肥则多采用叶面喷施、冲施等方式进行。
施用时期：生物菌肥不是***肥，一般做底肥，如果追施，在作物的营养临界期和营养大量吸收期前1周施用，效果好。而在蔬菜等经济作物上，微生物菌剂应采用蘸根、灌根的方式进行集中施用，且施用量不能过大。
混合施用：前面提到过，不要将菌肥与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥(如***钾等)以及草木灰混合施用，可先施菌肥，隔48小时后再打药除草。若拌种，切忌与已拌好杀菌剂的种子混合使用。还要防止与未腐熟的农家肥混合施用。 猕猴桃生物菌肥零售价格误区：靠见效速度评价产品好坏，认为见效快的就是好菌剂或菌肥。
果树用完生物肥的实际验证结果：
对果品品质的影响。在苹果、葡萄、梨、草莓和猕猴桃等多个树种上的研究结果表明，微生物肥料明显提高了果品品质。内在品质上主要提高了果实的可溶性固形物和含糖量、糖酸比和香气品质；从外在品质看，提高了果实着色度和硬度，果形大小较匀称。
施用微生物肥料有效增加了果实单果重并显着提高了单位面积产量，果园施用微生物肥料后，苹果、桃、葡萄、李子的产量，分别增产29.8%、27.7%、12.6%、21.1%
设施桃树上施用微生物肥料后，显着提高了土壤温度，10厘米根际土壤温度平均升高2.2℃；促进了土壤表层根系的发生与生长，细根数量比对照增加1.5倍；明显提高了桃的坐果率
为什么10个亿菌的比1个亿的还便宜？
微生物的成本应该由三部分组成：有效功能菌、载体和其他添加物菌固然是成本的首要因素，否则就不是菌肥了。但目前菌、功能菌、活菌、基础菌、总菌数、菌落数、根际细菌，五花八门的叫法很多。
定义不同，意义就不同，随意抓片树叶就含菌几万，不能说这含菌的树叶就值多少钱。各种定义的菌差异很大，确切的概念应该是有效功能菌；不同的菌种，功能、效果不同，成本也会有很大差异。
千万不要被标示的5亿，10亿，甚至15亿的菌含量所蒙蔽，国家标准：微生物菌剂产品颗粒的是≥1亿，液体是≥2亿。生物有机肥是≥0.2亿，是国家相关**经过多年的理论和实践制定的。看到动辄标示的10亿、15亿菌含量的微生物菌肥一定要注意。 微生物肥料是以微生物的生命活动导致农作物得到特定的肥料效应而使作物生长茁壮或产量增加的一类制品。
在国家颁布的微生物肥料执行标准中，都允许生产颗粒性微生物肥料。
《生物有机肥》执行标准中规定：粉剂产品应松散、无恶臭味；颗粒产品应无明显机械杂质、大小均匀、无***味。
《复合微生物肥料》执行标准中规定：产品按剂型分为液体、粉剂、颗粒型。粉剂产品应松散；颗粒产品应无明显机械杂质、大小均匀、具有吸水性；
《农用微生物菌剂》执行标准中规定：产品按剂型可分为液体、粉剂、颗粒型。由以上国家规定来看，说粉剂微生物肥料是真，颗粒微生物肥料是假，纯属子虚乌有。 一般菌肥在酸性土壤中直接施用效果较差，如硅酸盐细菌需要在PH7-8土壤中生存。贵州生物菌肥介绍
土壤功能退化，作物生长不良、病害加重、品质下降及产量降低甚至绝收等问题日益严重.贵阳工业生物菌肥
采集原始菌群比较好在当地林木茂密的山上选点，树木越多，生长年头越长，其林下积累的枯枝落叶就越多，这些枯枝落叶在各种生物菌的作用下形成厚厚的一层落叶土，这种落叶土就富含各种土著菌。采集时间比较好在早春进行，早春的温度较低，有利于发酵用酵母菌的繁殖，而不利于细菌、放线菌等的繁殖。
米饭是微生物的喜欢，用电饭煲蒸一锅米饭；等米饭凉后松散开，并埋入林下的落叶土中；大概10天左右米饭中就会出现大量白色的菌丝(温度高时时间会短些)；这样米饭团就变成了富含各种土著菌，特别是酵母菌的原始菌群了(图1)。其实在林下收集有白色菌丝的树皮、落叶也可用来直接制作菌剂。方便的地方直接用落叶土(10%的比例)和堆肥原料一起堆肥也可以。
a.将米饭埋入落叶土中。b.取出富集原始菌的饭团。c.收集到的原始菌群。d.将原始菌群和麦麸一起发酵。e.及时翻倒。f.将阴干的菌肥装袋放置： 贵阳工业生物菌肥
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