施用温度：要合理施用菌肥的比较好温度是22℃－35℃，低于5℃，高于40℃，施用效果较差。对高温、低温、干旱条件下的农作物田块不宜施用。在对温室大棚里的土壤或蔬菜育苗用营养土消毒后，至少要经过10-15天，才可以施用生物菌肥，切记不可施用生物菌肥后再实行土壤消毒。不应同时使用菌肥与杀菌剂、杀虫剂、除草剂。一般先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。施用地块：生物菌肥的使用效果和土壤的情况有关。土壤太旱或太湿都不利于生物菌肥效力的发挥，适宜的土壤湿度为60%左右。要适宜对含硫高的土壤和锈水田，不宜施用生物菌肥，因为硫元素能杀死生物菌。对于翻浆的水田，一般不用撒施，用喷雾的方法效果会好些。对于生物有机肥，采用穴施或沟施的方式进行，不建议冲施。复合微生物肥则多采用叶面喷施、冲施等方式进行。生物菌肥如果在水田使用，比较好于清晨或傍晚采用喷施的方法市场上出现的各种生物肥料，实际上是含有大量微生物的培养物。它们可以是粉剂或颗粒，也可以是液体状态。广西湿地生物菌肥技术指导
果实品质明显提高：菌群中的侧孢芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌等可降低植物体内硝酸盐含量20%以上，能降低重金属含量，可使果实中Vc含量提高30%以上，可溶性糖提高2~4度。乳酸菌、嗜酸乳杆菌、凝结芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等可提高果实中必需氨基酸(赖氨酸和蛋氨酸)、维生素B族和不饱和脂肪酸等的含量。果实口感好，耐储藏，卖价**解有机物质和***，防止重茬：菌群中的米曲菌、地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等有益微生物能加速有机物质的分解，为作物制造***养分、提供动力，能分解连作有毒有害物质，防止重茬。江西原产地生物菌肥制造商可以改善土壤团粒结构，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况。
种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。避免光照直射。光照直射的情况下，一些菌都会杀死。
综上所述，从官方发布的标准里，我们看到《农用微生物菌剂GB20287-2006》是没有有机质、氮磷钾的要求。但是菌含量、杂菌率等质量要求，是比执行《生物有机肥NY884-2012》类的要求高得多，如果是用普通生物有机肥料NY884-2012来冒充生物菌肥GB20287-2006标准，你可以举报它了。如果你买的产品是“生物有机肥”，而执行“农用微生物菌剂”的国家标准，等于是该产品的技术参数提高了10倍；同时，它的原料必须经过高温灭菌才能保证杂菌率达标（一般的有机质中杂菌含量都超标）。这些都大幅度增加它的成本，好多厂家并没有按要求来做，所以提醒各位老乡，价格和价值往往是成正比的，千万不要贪小便宜，吃大亏，用生物菌肥的钱买了普通的生物有机肥料。于各种常用化肥·有机肥配合使用，提高肥料的利用率，增产增收效果***。
玉米上用微生物菌肥效果特别好，因为它不仅能可做基肥也可做追肥，具体用法是：1.基肥：每亩施用有机肥3000千克施肥方法可以采用沟施或穴施方法，同时根据土壤性质配合适量的氮肥、磷肥。2.追肥：每亩施肥量低于20千克标准氮肥时，宜在拔节中期一次追肥杆穗齐攻。一般早熟品种播后30天左右，即"喇叭口期"，追肥为好。中熟品播种后25天左右，追肥为好。晚熟品种播后35--4天追肥为好。每亩施用量超过20千克标准氮肥的，以分次追肥为好。重点放在攻杆和攻穗肥。各地一般采用二次追肥，一般以前重后轻，即攻杆肥占60%--70%为好，攻穗肥占30%---40%为好，在拔节、孕穗期喷施微量锌和硼。生物菌肥中的菌种能够与作物根系共生，增加根系表面积，提高养分吸收效率，从而显著提高作物的产量和品质。海南便宜生物菌肥售后保障
《农用微生物菌剂》执行标准中规定：产品按剂型可分为液体、粉剂、颗粒型。广西湿地生物菌肥技术指导
二、生物菌肥可以单独使用，但是与经过腐熟的有机肥混合使用，其效果要远好于单独施用有机肥或生物菌肥。生物菌肥不宜与化肥直接混合使用，高浓度的化学物质对生物菌肥里的微生物有毒害作用，尤其要注意不应将菌肥与含硫的化肥（如硫酸钾等）及草灰混合用，因为这样的肥料更容易杀死菌肥里的有益菌。三、在对温室大棚里的土壤或蔬菜育苗用营养土后，至少要经过10-15天，才可以施用生物菌肥，切记不可施用生物菌肥后再实行土壤。不应同时使用菌肥与剂、杀虫剂、除草剂。一般先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好剂的种子混合使用。广西湿地生物菌肥技术指导
